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如何用MEGA和Clustalx构建进化树(请问怎么样用Clustal制作系统进化树?谢谢!)

作者:佚名      发布时间:2021-09-03      浏览量:29244
如何用MEGA和Clustalx构建进化树如何用MEGA和Clustalx构建进化树序列比对建议用ClustalX建NJ或MP树,用MEGA就可以了,非常方便若要建ML树推荐用phyML建Bayes树推荐用Parallel MrBayes

如何用MEGA和Clustalx构建进化树


如何用MEGA和Clustalx构建进化树序列比对建议用ClustalX建NJ或MP树,用MEGA就可以了,非常方便若要建ML树推荐用phyML建Bayes树推荐用Parallel MrBayes @ BioHPC如果不是专业建树的话,MEGA足够用了,建议参考下面这


请问怎么样用Clustal制作系统进化树?谢谢!


要构建一个进化树CLUSTALX是比较常用的。构建进化树的算法主要分为两类:独立元素法和距离依靠法。所谓独立元素法是指进化树的拓扑形状是由序列上的每个碱基/氨基酸的状态决定的(例如:一个序列上可能包含很多的酶切位点,而每个酶切位点的存在与否是由几个碱基的状态决定的,也就是说一个序列碱基的状态决定着它的酶切位点状态,当多个序列进行进化树分析时,进化树的拓扑形状也就由这些碱基的状态决定了)。而距离依靠法是指进化树的拓扑形状由两两序列的进化距离决定的。进化树枝条的长度代表着进化距离。


一般

如何使用 PhyML构建进化树


序列比对建议用ClustalX
建NJ或MP树,用MEGA就可以了,非常方便
若要建ML树推荐用phyML
建Bayes树推荐用Parallel MrBayes @ BioHPC
如果不是专业建树的话,MEGA足够用了,建议参考下面这篇文章:
一、引言
开始动笔写这篇短文之前,我问自己,为什么要写这样的文章?写这样的文章有实际的意义吗?我希望能够解决什么样的问题?带着这样的疑惑,我随手在丁香园(DXY)上以关键字“进化 分析 求助”进行了搜索,居然有289篇相关的帖子(2006年9月12日)。而

如何做进化树


用MEGA软件

两种方法
1,基于特定基因的序列来做进化树,看的是序列之间的相似性。
2,基于全基因组的snp来做进化树,通过全基因组范围内的snp来做分型和进化分析。


如何用mega root 进化树


lz你好,目前手机root的方法有很多
获取权限之后,怎样使用权限也有专门的软件
推荐lz使用应用宝上的工具:一键root或者kingroot软件啊
lz可以给手机下载一个应用宝的软件,搜索这连个软件其中的一个就可以
然后点击kingroot或者是一键root,勾选相应免责条款,下载kingroot插件或一键root插件,根据提示轻松完成手机root
或者电脑下载一个应用宝客户端
连接手机usb或无线到电脑,打开手机usb调试,打开应用宝软件,点击一下绿色连接手机,
先使用应用宝的数据备份还原功能备